黑珍珠号原本并不是海盗船，而是当时英国东印度贸易公司旗下的一艘贸易商船，而杰克当时就是这艘商船的船长。杰克和这艘船的缘分也是就此开始的。

当时杰克被东印度公司指派去非洲运送一批货物，后来杰克发现这所谓的货物竟然是非洲当地的黑人，等待他们的命运就是成为奴隶。杰克处于正义感便释放了这批奴隶，因此他被东印度公司关入了土耳其监狱，并且被烙上象征海盗的P字样，从此成为一名海盗。而黑珍珠号也被当时东印度总督贝克特沉入大海。

在杰克刑满驱逐之后，为了找回他心爱的船只，便去找“飞翔的荷兰人”号的船长戴维•琼斯。最终戴维•琼斯帮助杰克得到了他的爱船并重新命名为“黑珍珠号”，代价是杰克在当够13年的船长后就要去“飞翔的荷兰人”号上服役100年。

之后的剧情大家也基本都了解了，就如《加勒比海盗》电影里一般杰克和他的黑珍珠号开始了传奇般的各种经历，虽然数度分离，但黑珍珠号始终是属于杰克的，他们的传说也遍及整个加勒比海！

《加勒比海盗》中的杰克船长一直都是我行我素，对什么都满不在乎的神奇人物，对于被诅咒的金币他无所谓，对于荷兰号他不感冒，甚至不老泉他也可有可无。

但就是这样一个人，却对黑珍珠号执念颇深，用尽自己所有的力量去守护它，很多人对此感到疑惑，甚至有人认为黑珍珠号可能是什么巨额宝藏的通行证。

但其实道理很简单，船长这么看重它因为黑珍珠号是属于杰克自己的，是自由的象征。

纵观整个大航海时期，都不难发现绝大多数海盗船都是用女性名字命名的，黑珍珠也在其列，并且在海盗口中，都是用“她”来称呼自己的船，因为对于漂泊海上的海盗而言，给自己一方容身之所的船就象征着远方的故乡、母亲和妻子。

所以对于杰克来说，黑珍珠不仅仅是一艘船，更是他情感的寄托，是他真正的私人财产。

而另一个原因，就是自由，一个船长如果没有自己的船，那还有什么意义，只有在自己的穿上发号施令，掌舵航行还是一个海盗最大的自由。

而黑珍珠无疑是所有船里非常优秀的一艘。流线型的船身和巨大的动力都保证了它极快的速度。

而更关键的是，船如其名，黑珍珠通体黑色，暗夜行舟，就如海上幽灵，能够更好的隐蔽，可以说黑珍珠本身就是海盗最强大的武器。

所以面对既是情感寄托，又是强大武器的黑珍珠，杰克是不可能轻言放弃的。