DDANet: Dual Decoder Attention Network for Automatic Polyp Segmentation
创始人
2024-02-07 23:11:44

双decoder用于息肉分割。文章的创新点在与使用了双分支的decoder,单encoder的结构。decoder的第二个分支会产生注意力map,在代码中体现为输出通道为1。这个和之前看的confidence map很像。
看一下文章的结构图:
在这里插入图片描述
在decoder中,第二个分支生成注意力图,其实shared encoder的跳连接上下两个是一样的,在代码中可以看到,稍后分析。
encoder,decoder的构成:
在这里插入图片描述
他这里使用的encoder不是原始的resnet,但是使用了resnet的思想,且在两个3x3卷积之后,加入了通道注意力,这个在ESANet中RGB和Depth融合方法中也有用到。
在decoder使用的4倍转置卷积,和encoder的特征进行concat,和RedNet的跳连接结构,和上采样结构都很像。
实验:
医学图像的数据集,不太了解。
------------------------------------------------------分割线-------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
代码:


import torch
import torch.nn as nn
import torchvision.models as modelsclass SELayer(nn.Module):def __init__(self, channel, reduction=16):super().__init__()self.avg_pool = nn.AdaptiveAvgPool2d(1)self.fc = nn.Sequential(nn.Linear(channel, int(channel / reduction), bias=False),nn.ReLU(inplace=True),nn.Linear(int(channel / reduction), channel, bias=False),nn.Sigmoid())def forward(self, x):b, c, _, _ = x.size()y = self.avg_pool(x).view(b, c)y = self.fc(y).view(b, c, 1, 1)return x * y.expand_as(x)class ResidualBlock(nn.Module):def __init__(self, in_c, out_c):super(ResidualBlock, self).__init__()self.conv1 = nn.Conv2d(in_c, out_c, kernel_size=3, padding=1)self.bn1 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.conv2 = nn.Conv2d(out_c, out_c, kernel_size=3, padding=1)self.bn2 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.conv3 = nn.Conv2d(in_c, out_c, kernel_size=1, padding=0)self.bn3 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.se = SELayer(out_c)self.relu = nn.ReLU(inplace=True)def forward(self, x):x1 = self.conv1(x)x1 = self.bn1(x1)x1 = self.relu(x1)x2 = self.conv2(x1)x2 = self.bn2(x2)x3 = self.conv3(x)x3 = self.bn3(x3)x3 = self.se(x3)x4 = x2 + x3x4 = self.relu(x4)return x4class EncoderBlock(nn.Module):def __init__(self, in_c, out_c):super(EncoderBlock, self).__init__()self.r1 = ResidualBlock(in_c, out_c)self.r2 = ResidualBlock(out_c, out_c)self.pool = nn.MaxPool2d(2, stride=2)def forward(self, x):x = self.r1(x)x = self.r2(x)p = self.pool(x)return x, pclass DecoderBlock(nn.Module):def __init__(self, in_c, out_c):super(DecoderBlock, self).__init__()self.upsample = nn.ConvTranspose2d(in_c, out_c, kernel_size=4, stride=2, padding=1)self.r1 = ResidualBlock(in_c+out_c, out_c)self.r2 = ResidualBlock(out_c, out_c)def forward(self, x, s):x = self.upsample(x)x = torch.cat([x, s], axis=1)x = self.r1(x)x = self.r2(x)return xclass CompNet(nn.Module):def __init__(self):super(CompNet, self).__init__()""" Shared Encoder """self.e1 = EncoderBlock(3, 32)self.e2 = EncoderBlock(32, 64)self.e3 = EncoderBlock(64, 128)self.e4 = EncoderBlock(128, 256)""" Decoder: Segmentation """self.s1 = DecoderBlock(256, 128)self.s2 = DecoderBlock(128, 64)self.s3 = DecoderBlock(64, 32)self.s4 = DecoderBlock(32, 16)""" Decoder: Autoencoder """self.a1 = DecoderBlock(256, 128)self.a2 = DecoderBlock(128, 64)self.a3 = DecoderBlock(64, 32)self.a4 = DecoderBlock(32, 16)""" Autoencoder attention map """self.m1 = nn.Sequential(nn.Conv2d(128, 1, kernel_size=1, padding=0),nn.Sigmoid())self.m2 = nn.Sequential(nn.Conv2d(64, 1, kernel_size=1, padding=0),nn.Sigmoid())self.m3 = nn.Sequential(nn.Conv2d(32, 1, kernel_size=1, padding=0),nn.Sigmoid())self.m4 = nn.Sequential(nn.Conv2d(16, 1, kernel_size=1, padding=0),nn.Sigmoid())""" Output """self.output1 = nn.Conv2d(16, 1, kernel_size=1, padding=0)self.output2 = nn.Conv2d(16, 1, kernel_size=1, padding=0)def forward(self, x):""" Encoder """x1, p1 = self.e1(x)x2, p2 = self.e2(p1)x3, p3 = self.e3(p2)x4, p4 = self.e4(p3)""" Decoder 1 """s1 = self.s1(p4, x4)a1 = self.a1(p4, x4)m1 = self.m1(a1)x5 = s1 * m1""" Decoder 2 """s2 = self.s2(x5, x3)a2 = self.a2(a1, x3)m2 = self.m2(a2)x6 = s2 * m2""" Decoder 3 """s3 = self.s3(x6, x2)a3 = self.a3(a2, x2)m3 = self.m3(a3)x7 = s3 * m3""" Decoder 4 """s4 = self.s4(x7, x1)a4 = self.a4(a3, x1)m4 = self.m4(a4)x8 = s4 * m4""" Output """out1 = self.output1(x8)out2 = self.output2(a4)return out1, out2if __name__ == "__main__":x = torch.rand((1, 3, 512, 512))model = CompNet()y1, y2 = model.forward(x)

我们直接看forward函数:
1:首先就是输入的x经过四个encoder block
在这里插入图片描述在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
每个block中包含的residual block:


class ResidualBlock(nn.Module):def __init__(self, in_c, out_c):super(ResidualBlock, self).__init__()self.conv1 = nn.Conv2d(in_c, out_c, kernel_size=3, padding=1)self.bn1 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.conv2 = nn.Conv2d(out_c, out_c, kernel_size=3, padding=1)self.bn2 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.conv3 = nn.Conv2d(in_c, out_c, kernel_size=1, padding=0)self.bn3 = nn.BatchNorm2d(out_c)self.se = SELayer(out_c)self.relu = nn.ReLU(inplace=True)def forward(self, x):x1 = self.conv1(x)x1 = self.bn1(x1)x1 = self.relu(x1)x2 = self.conv2(x1)x2 = self.bn2(x2)x3 = self.conv3(x)x3 = self.bn3(x3)x3 = self.se(x3)x4 = x2 + x3x4 = self.relu(x4)return x4

以第一个为例:输入通道为3,输出通道为32.
经过两个3x3卷积,然后一个1x1卷积的残差连接,注意,这里经过1x1卷积之后才经过SElayer。和图中画的有些不同。
SELayer:和之前看的通道注意力一样,首先经过平均池化,然后经过两个线性层,最后与原始的x相乘得到最终的结果。
在这里插入图片描述
每个encoder block包含两个残差块,一个2x2最大池化。注意这里返回的是x,用来跳连接的。 x, p对应于x1, p1 。同理x2为p1。encoder结束后,两个输出分别经过两个decoder分支。
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在这里插入图片描述
在decoder block中首先通过转置卷积进行上采样四倍,然后和跳连接相concat,再经过两个残差块。而另一条分支的处理和这一条一样的。
在这里插入图片描述
不同的是第二条分支产生的结果是一个注意力图。通过一个卷积生成通道为1的attention map,这里医学分割图的最终结果就是单通道,如果是其他的数据集即时多通道,即这里其实相当于之前说的置信度图。
在这里插入图片描述
生成的置信度图与第一条分支产生的结果相乘,这样执行四次。
在这里插入图片描述
最终的输出经过两个通道为1的卷积,即最终的分割图。
在这里插入图片描述
整个网络框架可以简化为:
在这里插入图片描述

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