R语言在逻辑回归中求R square R方
创始人
2024-03-08 05:15:26

 并非所有结果/因变量都可以使用线性回归进行合理建模。也许第二种最常见的回归模型是逻辑回归,它适用于二元结果数据。最近我们被客户要求撰写关于逻辑回归的研究报告,包括一些图形和统计输出。如何计算逻辑回归模型的R平方?  

 相关视频:R语言逻辑回归(Logistic回归)模型分类预测病人冠心病风险

逻辑回归Logistic模型原理和R语言分类预测冠心病风险实例

,时长06:48

McFadden麦克法登R平方

在R中,glm(广义线性模型)命令是用于拟合逻辑回归的标准命令。据我所知,拟合的glm对象并没有直接给你任何伪R平方值,但可以很容易地计算出McFadden的度量。为此,我们首先拟合我们感兴趣的模型,然后是仅包含截距的null模型。然后我们可以使用拟合模型对数似然值计算McFadden的R平方:

mod < -  glm(y~x,family =“binomial”)
nullmod < -  glm(y~1,family =“binomial”)
1-logLik(MOD)/ logLik(nullmod)

 为了了解预测器需要获得某个McFadden的R平方值的强度,我们将使用单个预测模型X来模拟数据, 我们首先尝试P(Y = 1 | X = 0)= 0.3和P(Y = 1 | X = 1)= 0.7:

set.seed(63126)
n < -  10000
x < -  1 *( (n)<0.5)
pr < - (x == 1)* 0.7 +(x == 0)* 0.3
y < -  1 *(  f(n)

 因此,即使X对Y = 1的概率有相当强烈的影响,McFadden的R2也只有0.13。要增加它,我们必须使P(Y = 1 | X = 0)和P(Y = 1 | X = 1)更加不同:

set.seed(63126)
n < -  10000
x < -  1 *(runif(n)<0.5)
pr < - (x == 1)* 0.9 +(x == 0)* 0.1
y < -  1 *( (n)

即使X将P(Y = 1)从0.1变为0.9,McFadden的R平方仅为0.55。最后我们将尝试0.01和0.99的值 - 我称之为非常强大的效果!

set.seed(63126)
n < -  10000
x < -  1 *(runif(n)<0.5)
pr < - (x == 1)* 0.99 +(x == 0)* 0.01
y < -  1 *( (n) pr)
mod < -  glm(y~x,family =“binomial”)
nullmod < -  glm(y~1,family =“binomial”)
1- (MOD)/  ( )
[1] 0.9293177

现在我们有一个更接近1的值。 

分组二项数据与单个数据

data < -  data.frame(s = c(700,300),f = c(300,700),x = c(0,1))SFX
1 700 300 0
2 300 700 1

 为了使逻辑回归模型拟合R中的数据,我们可以将因变量传递给glm函数, :

Call:
glm(formula = cbind(s, f) ~ x, family = "binomial", data = data)Deviance Residuals: 
[1]  0  0Coefficients:Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept)  0.84730    0.06901   12.28   <2e-16 ***
x           -1.69460    0.09759  -17.36   <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)Null deviance: 3.2913e+02  on 1  degrees of freedom
Residual deviance: 1.3323e-13  on 0  degrees of freedom
AIC: 18.371Number of Fisher Scoring iterations: 2

我们现在将分组的二项式数据转换为 伯努利 数据,并拟合相同的逻辑回归模型。 

individualData <-  (cbind(data,y=0),cbind(data,y=1))
individualData$freq <- individualData$s
individualData$freq[ $y==0] <-  $f[individualData$y==0]
mod2 <- glm(y~x, family="binomial",data= ,weight=freq)
summary(mod2)Call:
glm(formula = y ~ x, family = "binomial", data = individualData, weights = freq)Deviance Residuals: 1       2       3       4  
-26.88  -22.35   22.35   26.88  Coefficients:Estimate Std. Error z value Pr(>|z|)    
(Intercept)  0.84730    0.06901   12.28   <2e-16 ***
x           -1.69460    0.09759  -17.36   <2e-16 ***
---
Signif. codes:  0 ‘***’ 0.001 ‘**’ 0.01 ‘*’ 0.05 ‘.’ 0.1 ‘ ’ 1(Dispersion parameter for binomial family taken to be 1)Null deviance: 2772.6  on 3  degrees of freedom
Residual deviance: 2443.5  on 2  degrees of freedom
AIC: 2447.5Number of Fisher Scoring iterations: 4

正如所料,我们从分组数据框中获得相同的参数估计和推论。 

nullmod1 <- glm(cbind(s,f)~1, family="binomial",data)
nullmod2 <- glm(y~1, family="binomial",data=individualData, =freq)
1-logLik(mod1)/logLik(nullmod1)
'log Lik.' 0.9581627 (df=2)
1-logLik(mod2)/logLik(nullmod2)
'log Lik.' 0.1187091 (df=2)

我们看到分组数据模型的R平方为0.96,而单个数据模型的R平方仅为0.12。 

 

相关内容

热门资讯

猫咪吃了塑料袋怎么办 猫咪误食... 你知道吗?塑料袋放久了会长猫哦!要说猫咪对塑料袋的喜爱程度完完全全可以媲美纸箱家里只要一有塑料袋的响...
埃菲尔铁塔在哪 中国仿建埃菲尔... 2019年4月26日,广西南宁市,街头惊现一座巨型山寨版埃菲尔铁塔,高约20米,白色塔身,造型逼真,...
苗族的传统节日 贵州苗族节日有... 【岜沙苗族芦笙节】岜沙,苗语叫“分送”,距从江县城7.5公里,是世界上最崇拜树木并以树为神的枪手部落...
北京的名胜古迹 北京最著名的景... 北京从元代开始,逐渐走上帝国首都的道路,先是成为大辽朝五大首都之一的南京城,随着金灭辽,金代从海陵王...
世界上最漂亮的人 世界上最漂亮... 此前在某网上,选出了全球265万颜值姣好的女性。从这些数量庞大的女性群体中,人们投票选出了心目中最美...
应用未安装解决办法 平板应用未... ---IT小技术,每天Get一个小技能!一、前言描述苹果IPad2居然不能安装怎么办?与此IPad不...
长白山自助游攻略 吉林长白山游... 昨天介绍了西坡的景点详细请看链接:一个人的旅行,据说能看到长白山天池全凭运气,您的运气如何?今日介绍...
脚上的穴位图 脚面经络图对应的... 人体穴位作用图解大全更清晰直观的标注了各个人体穴位的作用,包括头部穴位图、胸部穴位图、背部穴位图、胳...
demo什么意思 demo版本... 618快到了,各位的小金库大概也在准备开闸放水了吧。没有小金库的,也该向老婆撒娇卖萌服个软了,一切只...
埃菲尔铁塔在哪 中国仿建埃菲尔... 2019年4月26日,广西南宁市,街头惊现一座巨型山寨版埃菲尔铁塔,高约20米,白色塔身,造型逼真,...
苗族的传统节日 贵州苗族节日有... 【岜沙苗族芦笙节】岜沙,苗语叫“分送”,距从江县城7.5公里,是世界上最崇拜树木并以树为神的枪手部落...
北京的名胜古迹 北京最著名的景... 北京从元代开始,逐渐走上帝国首都的道路,先是成为大辽朝五大首都之一的南京城,随着金灭辽,金代从海陵王...
应用未安装解决办法 平板应用未... ---IT小技术,每天Get一个小技能!一、前言描述苹果IPad2居然不能安装怎么办?与此IPad不...